過去兩年有一項大熱的技術(shù)，大量研究人員通過這項技術(shù)解決重要科學(xué)問題，發(fā)表了大量高水平學(xué)術(shù)文章，這項技術(shù)便是單細胞測序技術(shù)。
單細胞測序技術(shù)，在這兩年得到了蓬勃發(fā)展。一些高通量的單細胞測序平臺開始為大家所熟知。有10×genomics單細胞測序平臺、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。
這些平臺在很大程度上降低了單細胞測序的成本，使得單個細胞的測序成本變得很低。雖然單個細胞的成本降低了，但一個樣本需要產(chǎn)生大量細胞的數(shù)據(jù)，所以單個樣本的成本并沒有很低。大多數(shù)的研究者會因這幾十萬甚至上百萬的測序成本而對單細胞測序研究望而卻步。有些希望從事單細胞研究或者希望提供單細胞測序服務(wù)的單位，也會因為測序平臺高昂的價格而猶豫不決。
在這種形式下，上海凈信潛心研發(fā)兩年多，推出了單細胞測序平臺。該平臺基于Drop-seq的技術(shù)原理，能夠一次完成數(shù)千甚至上萬細胞的單細胞測序。
大家所熟知的10×genomics單細胞胞測序平臺依托的技術(shù)手段稱之為inDrop-seq，論文在2015年發(fā)表與Cell雜志。該方法利用微液滴技術(shù)將帶有條形碼、索引分子、引物及其他的凝膠珠與單細胞混合。每個液滴內(nèi)開展逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，以產(chǎn)生測序所用的帶有條形碼的cDNA。
10×genomics單細胞測序平臺原理圖
有意思的是，凈信使用的Drop-seq技術(shù)與inDrop-seq技術(shù)發(fā)表與同一期的Cell雜志上。Drop-seq也是利用微流控技術(shù)將細胞分開，并與帶有特定條形碼的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)將細胞內(nèi)的信使RNA捕獲。收集磁珠凈信逆轉(zhuǎn)錄和擴增，得到測序所用的帶有條形碼的cDNA。與inDrop-seq不同的是，Drop-seq的逆轉(zhuǎn)錄的過程是在液滴外進行的，這樣逆轉(zhuǎn)錄的效率會更高。
凈信單細胞測序儀原理圖
凈信的單細胞測序儀不管是從原理還是從測試結(jié)果看，都完全能媲美進口儀器。它每個樣本能夠產(chǎn)生5000~10000個細胞，對上機樣本的要求不再那么嚴苛。為防止實驗失敗造成的損失，機器還特別添加了能夠監(jiān)控實驗過程的系統(tǒng)，一旦出現(xiàn)管道堵塞等情況，便可以及時止損。而關(guān)鍵的還是：該平臺不論是從機器的購買成本，還是試劑耗材的成本都非常低。該平臺的問世，再次將單細胞測序的價格拉低了一個臺階，使得更多的研究人員能夠去利用這一先進的技術(shù)手段進行研究工作。
凈信單細胞測序儀樣機圖
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